一百年前，沙漠城市「荒漠市」
因小精灵们的对战而蒙受极大损害。
这场对战的开端，源自某只小精灵的存在。
然而，那只小精灵遭到某个人封印，
如今荒漠市已恢复以往的宁静。
小智一行人在旅行途中，
遇见了拥有“能拿出所有物品的光环”的幻之小精灵·胡帕，
以及负责照顾它的少女·梅雅利。
爱捣蛋的胡帕，从那个神奇光环中拿出它最爱的甜甜圈之类的物品，
它以拿出各种物品来吓人为乐。
天真的胡帕喜欢捣蛋，
还称呼小智和皮卡丘为“小知”跟“皮卡”，
完全成为好朋友的胡帕和小智一行人，决定一起去旅行。
抵达荒漠市的小智一行人，
遇到了梅雅利的哥哥·巴尔札。
但是，巴尔札的样子似乎怪怪的。
仔细一瞧，他手里拿着据称封印了
在过去破坏了城市的小精灵的「惩戒之壶」。
壶里散发出一般邪恶气息，
在历经漫长的岁月后，壶的封印好像被解开了。
